在高新企业认定和计算加计扣除基数时，研发费用的归集口径是不一致的

人员人工费用

研发费用加计扣除：直接从事研发活动人员的工资薪金、基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费和住房公积金，以及外聘研发人员的劳务费用。

高新技术企业认定：企业科技人员的工资薪金、基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费和住房公积金，以及外聘科技人员的劳务费用。

备注：高新技术企业人员人工费用归集对象是科技人员。

直接投入费用

研发费用加计扣除：

（1）研发活动直接消耗的材料、燃料和动力费用。

（2）用于中间试验和产品试制的模具、工艺装备开发及制造费,不构成固定资产的样品、样机及一般测试手段购置费,试制产品的检验费。

（3）用于研发活动的仪器、设备的运行维护、调整、检验、维修等费用，以及通过经营租赁方式租入的用于研发活动的仪器、设备租赁费。

高新技术企业认定：

（1）直接消耗的材料、燃料和动力费用。

（2）用于中间试验和产品试制的模具、工艺装备开发及制造费，不构成固定资产的样品、样机及一般测试手段购置费,试制产品的检验费。

（3）用于研究开发活动的仪器、设备的运行维护、调整检验、检测、维修等费用，以及通过经营租赁方式租入的用于研发活动的固定资产租赁费。

备注：房屋租赁费不计入加计扣除范围。

折旧费用与长期待摊费用

研发费用加计扣除：用于研发活动的仪器、设备的折旧费。

高新技术企业认定：用于研究开发活动的仪器、设备和在用建筑物的折旧费。研发设施的改建、改装、装修和修理过程中发生的长期待摊费用。

备注：房屋折旧费不计入加计扣除范围。

无形资产摊销

研发费用加计扣除：用于研发活动的软件、专利权、非专利技术(包括许可证、专有技术、设计和计算方法等)的摊销费用。

高新技术企业认定：用于研究开发活动的软件、知识产权、非专利技术(专有技术、许可证、设计和计算方法等)的摊销费用。

设计实验等费用

研发费用加计扣除：新产品设计费、新工艺规程制定费、新药研制的临床试验费、勘探开技术的现场试验费。

高新技术企业认定：符合条件的设计费用、装备调试费用、试验费用(包括新药研制的临床试验费、勘探开发技术的现场试验费、田间试验费等)。

其他相关费用

研发费用加计扣除：

此项费用总额不得超过可加计扣除研发费用总的10%。

（1）与研发活动直接相关的其他费用，如技术图书资料费、资料翻译费、专家咨询费、高新科技研发保险费。

（2）研发成果的检索、分析、评议、论证、鉴定、评审、评估、验收费用，知识产权的申请费、注册费、代理费，差旅费、会议费

（3）职工福利费、补充养老保险费、补充医疗保险费。

高新技术企业认定：

此项费用一般不得超过研究开发总费用的20%，另有规定的除外。

（1）与研究开发活动直接相关的其他费用，包括技术图书资料费、资料翻译费、专家咨询费、高新科技研发保险费

（2）研发成果的检索、论证、评审、鉴定、验收费用，知识产权的申请费、注册费、代理费，会议费、差旅费、通讯费等。

备注：加计扣除政策及高新研发费用范围中对其他相关费用总额有比例限制。

人员人工。加计扣除口径中人员人工包括直接从事研发活动人员的工资薪金、“五险一金”，以及外聘研发人员的劳务费用。而高新认定归集口径指的是企业科技人员工资薪金、“五险一金”、及外聘科技人员劳务费用，其中科技人员是指直接从事研发和相关技术创新活动，以及专门从事上述活动的管理和提供直接技术服务的，累计实际工作时间在183天以上的人员。

直接投入。加计扣除中的直接投入包括材料、燃料、动力费用以及专门用于中间试验和产品试制的模具、工艺装备开发制造费，研发设备、器具的租赁费。而高新认定中除上述内容外，还包括用于研发的房屋租赁费。

折旧费用和长期待摊费用。加计扣除中该项只包括专门用于研发活动的仪器、设备的折旧费或租赁费。而高新认定中还包括研发在用建筑物的折旧以及研发改建、修理中的长期待摊费用。

其他费用。由于高新认定时采取了不完全列举的方法，而加计扣除则采取正列举的方法，加计扣除政策中未列举的项目都不允许计入加计扣除的范围。而高新认定中的研发费还包括为研究开发活动所发生的其他费用，如办公费、通讯费、专利申请维护费、高新科技研发保险费等。

政策依据

1、《财政部国家税务总局 科技部关于完善研究开发费用税前加计扣除政策的通知》（财税〔2015〕119号）

2、《国家税务总局关于研发费用税前加计扣除归集范围有关问题的公告》（国家税务总局公告2017年第40号）

3、《科技部 财政部 国家税务总局关于修订印发《高新技术企业认定管理办法》的通知》（国科发火〔2016〕32号）

4、《科技部 财政部 国家税务总局关于修订印发<高新技术企业认定管理工作指引>的通知》（国科发火〔2016〕195号）